L'àmbit territorial del PAHT comprèn 44 municipis que formen part de dos estats i per això es va constituir l’any 2015 una  Agrupació Europea de Cooperació Territorial (AECT).

L’AECT és una eina de cooperació,  creada per la Unió Europea, per facilitar la realització i la gestió d’accions de cooperació territorial i desenvolupament en àmbits transfronterers, a causa de les diferències entre legislacions i procediments nacionals. Per superar aquests obstacles, la Unió Europea va crear aquest instrument dotat de personalitat jurídica i amb uns estatuts i un conveni aprovats pels membres que en formen part i pels dos estats.

Els òrgans de funcionament

La governança de l’AECT recau en una Assemblea (Comitè Sindical) composada per delegats que representen els membres de l’AECT, és a dir, als 44 municipis signataris del conveni de l’AECT País d’Art i d’Història Transfronterer de les Valls Catalanes.

L’Assemblea escull el President/ta i tres vicepresidents/tes que seran assistits per una Mesa, formada per dotze delegats. Els mandats són de dos anys i l’òrgan directiu es va alternant entre els cinc territoris que formen part de l’AECT (Vallespir, Alt Vallespir, Ripollès, Alta Garrotxa i Alt Empordà).

El Comitè Científic i Tècnic està format pels membres del dispositiu en xarxa del Centre d’Interpretació de l’Arquitectura i del Patrimoni i els membres científics. El Comitè participa a la posada en funcionaments d’accions coordinades a escala de la xarxa territorial.

L’organisme disposa d’un director i tècnics/tècniques per la gestió i per l’execució de projectes.